Das EIT verfolgt einen grundsätzlich neuen Ansatz für die Bewältigung der gesteckten Ziele. Im Mittelpunkt der Strategie steht das sogenannte Wissensdreieck "Forschung - Innovation - Bildung". Das EIT ist in zwei Ebenen gegliedert. Den Verwaltungsrat, mit Sitz in Budapest und den sogenannten Wissens- und Innovationsgemeinschaften (Knowledge and Innovation Communities – KICs).
KICs stellen die operativen Einheiten des EIT dar und werden in transdisziplinären Bereichen von strategischer Bedeutung arbeiten. In den KICs werden die drei Seiten des Wissensdreiecks – Ausbildung, Forschung und Innovation – derart miteinander verbunden, dass neue Synergien und Kooperationsformen entstehen. Ein Schwerpunkt wird dabei nicht zuletzt auf Entrepreneurship und Neugründungen gelegt.
Derzeit gibt es drei bestehende KICs in den Themenbereichen Klimawandel, erneuerbare Energien und Informations- und Kommunikationstechnologie.
Für Unternehmen und Universitäten stellen KICs eine große Chance dar, mit den Weltbesten zusammenzuarbeiten und davon entsprechend zu profitieren.